1939年3月21日，委員長派遣殺手進河刺殺汪衛，失敗。
同月，軍統局總部再次進行改組。
改“科”為“”。
秘書室設四科九、工作人員招待所和診療所，由秘書主任人統一管理。
第一科改第一，又管理，下設四科五。
第二科改第二，又報，下設軍事科、政治科、國際科三科，又設作戰、敵、軍警團隊、行機關、秘社團、日偽漢、歐外事七。
從這一設定來看，二為整個軍統局重中之重。
長為軍統局上海潛伏區區長孟紹原！
孟紹原權勢滔天。
重慶戴老闆，上海孟爺。
這一說法已經被軍統局上上下下所接。
孟紹原不在重慶期間，由副長王南星主持工作。
這一時期的孟紹原，開始逐漸走上巔峰。
有人也曾經提出異議，說孟紹原既是上海區的區長，又兼任第二的長，人在上海，如何管理第二？略有不妥，建議重新安排二長人選。
但這一提議無人理會。
孟紹原後站著的，是戴笠，是孔祥熙，甚至那位委員長也對他青睞有加。
而在外勤組織方面，則細分為“華中”、“華東”、“華南”、“華北”、“國際”、“其他”，其下再分各“區”、各“站”、各“組”、各“小組”。
華東方面為上海潛伏區更名為上海區，區長孟紹原。南京區，區長錢新民。杭州站，站長，站長徐松堅。浙江站，站長襄。安慶站，站長周翼。屯溪站，站長曹飛鴻。
統計外勤組織數目，報佈置計有區10、站36、組165、小組128。
至1939年，軍統局註冊特工為9314人，不含外圍員。年齡集中在21到35歲。其中21到25歲最多。
這一年齡段犧牲者也最多。
比如在南昌犧牲的季雙，時年僅僅只有22歲。
這個年紀，正是青春年的時候，可就是這麼一群年輕人，已經在各條戰線流、犧牲。
而更加讓人到震驚的是：
軍統局人員的教育水平為全國最高！
是大學及專科人員就有990人，國外留學生為174人！
其註冊特工，學歷最低的也接完了小學教育，為1072人。
所以，在孟紹原那個時代，很多影視作品裡一旦出現特務，都是沒有文化不學無的混混，是嚴重不準確的。
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