衛軍的兵源並非來自原先的京營衛所兵，而是由戚繼在河北民間招募。由於衛軍立時間不長，所經歷的戰爭也還不算多，這些民間招募來計程車兵一時半會兒顯然難以長為將領，因此衛軍的將領來源就比較複雜了。
總的來說，衛軍的將領以及中層軍來源有三個部分。
第一部分是戚繼的嫡系。這其中真正的“老將”只有吳惟忠一人，餘者都是中層將校，在衛軍系中，大多是位於連、排、棚這個級別的軍，另外有幾名營級軍。
這種安排是戚繼在請示高務實之後才做出的，原因有兩點：一來衛軍屬於朝廷嫡系，甚至可以說是天子親軍(其作用有別於錦衛)，而戚繼並非勳貴一系，顯然不敢在這樣一支軍隊裡安排太多自己的親信將領，以免到時候彈章如雪，吃罪不起。
二來真正意義上的“戚家軍”主力已經被戚金帶走，去了遼東戍邊。軍隊既然走了，將領當然也得跟著走，除了一些早年已經積功升去了全國各地的將領外，當時還在軍中的將領基本都跟著戚金走了。
至於吳惟忠，他是戚繼邊的得力干將，也是戚家軍的“老人”，戚繼總要留個知心人在邊理各種事務，否則他自己單槍匹馬帶這麼大一支軍隊，那不得累死？
衛軍的第二部分將領，來源於宣大三鎮以及薊州、昌平、保定等鎮。這其中，毫無疑問宣大三鎮屬於高務實的嫡系；薊鎮雖然不是戚繼的嫡系，但屬於戚繼的老部下；昌平、保定等鎮則是高務實的輻範圍，大致可以看做高務實麾下的旁系將領，或者說泛實學派將領——他們投靠的文臣大佬屬於實學派。
至於第三部分，自然就是勳貴、功臣的子弟了。這是沒法子的事，衛軍的屬擺在這裡，如果軍中一個勳貴子弟和功臣蔭子都沒有，別說朝廷文武百不放心，連朱翊鈞恐怕都要在心裡打個突。
這部分將領都不是勳貴本人或其直系，通常是次子及餘子，比如朱應楨的弟弟朱應槐、張元功的弟弟張元德等人。此外則還有來自於全國各地功臣名將之後，這部分以將門恩蔭為主，比如高務實麾下著名的嫡系將門麻氏，就有麻承訓(不是麻承勳)、麻承宣、麻承詔三人被麻貴一腳踢到了衛軍。
其餘將門，尤其是高務實的嫡系將領們也有這樣的待遇，只要該將領本人獲賞恩蔭，高務實在方便的況下都會幫忙“作”一番，讓他們按照恩蔭的級別進衛軍鍛鍊。
在高務實看來，這是在現有制下最好的解決辦法，不僅僅是雙贏，甚至是三贏：高務實本人、將門、朝廷，都是益方。
而且，相較於這些將門始終留在本鎮世襲，高務實認為把他們海納百川一般收進衛軍會更好一些。一來避免將門在本鎮的勢力繼續滾雪球一般膨脹起來，一來也讓他們在衛軍系形良競爭。
武將嘛，你不服我，我不服你。你說你們鐵嶺李氏是天下第一將門，我大同麻氏就是不服。以前大家不好比劃比劃，現在可方便了——衛軍有季訓、有年比，大家是騾子是馬拉出來溜溜，看誰帶的兵厲害！
什麼打破固化、良競爭？這就是了。
戚繼一直說高務實的這個辦法簡直是個天才設想，不過他還是提出過一個補充建議，那就是既然這樣辦了，那麼衛軍的司令就一定不能挑一個有明顯立場偏向的人。
戚繼本人是出了名的帶兵嚴厲和事公平，他能保證自己不偏心，但他很擔心高務實將來安排的衛軍司令繼任者偏心，是以有此一說。
但其實這事高務實也沒法一口答應，衛軍雖然是他所締造，但他又不是皇帝，哪裡能保證將來的歷任司令是誰？只能說在自己的影響範圍會舉薦相對更公正的繼任者。不過這事暫時倒也不著急，戚繼的任期還沒結束，而且他還應該能連任一屆。
今天來的衛軍將領倒也不多，除了戚繼本人之外，就只來了個麻承宣作為將門代表，勳貴之家倒沒派人來，大概是因為今晚勳貴們要拜會高務實的緣故。
雙方一見面，戚繼就先提出了自己的擔憂，原來他來倒不是為了別的事，而是擔心衛軍現在的系會不會出現變化。
前文曾說過，京營改制這事大明朝廷其實是一直都在搞的，前前後後改了好多回，推到重來、制度回滾之類的況經常出現。戚繼就是擔心這一點，他生怕好不容易有點樣子的衛軍因為高務實離任，朝廷莫名其妙又給“制度回滾”了之前的模樣，那他這麼久以來的心就白費了。
這一點高務實還是可以保證的，安戚繼道：“南塘公不必多慮，京營改制是皇上的宸斷，皇上早在極之便有此意，本部堂在其中不過是做些建議罷了。
皇上之所以這樣做，想必南塘公也清楚，都是為了徹底消除北疆患。也正因如此，衛軍在察哈爾被消滅之前絕不可能出現大的變化，而只要衛軍在覆滅殘元之戰中表現出，眼下的制度也就有足夠的理由留存下來。
所以，南塘公，衛軍與其現在擔心這些，倒不如進一步抓訓練，儲備資，爭取在那一戰中打出威名，立下殊功，奠定萬世之基。”
戚繼點了點頭，輕嘆一聲，自嘲道：“大司農所言自是正理，只是心在此，終不免心中忐忑罷了。”
高務實又隨口安了兩句，轉頭問麻承宣：“麻標統，你所來又為何事？”
麻承宣苦笑躬，先告罪道：“大司農恕罪，本來卑職是沒打算來的，只是不巧叔父來函，言及此番隨大司農出征西北之後，我大同諸衛又仗大司農虎威而獲不功賞，其中有不同僚聽說衛軍演嚴格，訓練刻苦，都希將家中餘子送來……”
高務實聽了之後稍稍思索，搖頭道：“衛軍如今無缺，這你是知道的，即便本部堂未曾卸任，這事一時之間也不好辦了。”
麻承宣苦笑道：“是，是，卑職自然是知道的，只是……呃，卑職覺得叔父大概也是被纏得沒法，只好讓卑職來一趟，至不讓人背後說咱們麻家的閒話。”
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