船員們聽了，紛紛振起來："提督說得對！我們是大明水師，不怕風浪！"
航行的第二十五天，艦隊抵達了呂宋島附近海域。
"前方發現船隻！"瞭手突然高聲報告，"看旗號，是西班牙人的船！"
鄭芝龍立即拿起千里鏡觀察。只見遠海面上，三艘西式大帆船正向他們駛來。
"全艦隊警戒！"鄭芝龍下令，"準備戰鬥，但不要先開火。讓商船隊退到後方！"
西班牙船隊很快靠近，雙方隔著海面對峙。鄭芝龍注意到，西班牙船上的火炮數量雖然不及他們，但看起來口徑更大，程可能更遠。
"他們派了一艘小船過來，似乎想通話。"黃斌報告道。
鄭芝龍點點頭："我去會會他們。黃斌，你和幾個會西洋話的隨我一起。記住，保持警惕，但要有禮有節。"
小船上，鄭芝龍見到了西班牙艦隊的指揮，一個留著濃鬍鬚的中年人。
"我是馬尼拉總督府海軍上校佩德羅。"對方用生的漢語自我介紹，"你們是什麼人？為何帶著如此多的船隻進西班牙國王的領海？"
鄭芝龍冷笑一聲："這裡自古以來就是大明的海域。我是大明皇家水師南洋艦隊提督鄭芝龍，奉皇帝之命前來與呂宋進行貿易往來。"
雙方隨即展開了一場激烈的外辯論。西班牙人堅稱呂宋島已是他們的民地，任何外國船隻進都需獲得許可；鄭芝龍則強調大明與呂宋的傳統朝貢關係，並表明他們此行純屬和平貿易。
"上校先生，"鄭芝龍最後說道，"我們無意與貴國發生衝突，但也絕不會被無理阻攔。我建議，讓我們的商船在馬尼拉港進行正常貿易，互惠互利。否則..."他意味深長地看了一眼自己的艦隊，"後果恐怕對誰都不好。"
佩德羅權衡再三，最終同意讓大明商船進馬尼拉港，但限制了數量和停留時間，並要求戰船留在外海。
接下來的兩個月裡，艦隊沿著預定航線，先後訪問了呂宋、蘇祿、爪哇和馬六甲等地。他們與當地商人進行了富的貿易，換取了大量香料、珍珠、熱帶木材和其他奇珍異寶。同時，鄭芝龍也秘記錄了沿途各地的地理、政治和軍事況，特別是西方民者的活和勢力範圍。
在馬六甲，他們還與荷蘭人的船隊發生了小規模衝突。一艘荷蘭武裝商船試圖攔截一艘離大明艦隊保護的商船。鄭芝龍得知後，立即派出兩艘戰船前往救援，雙方在海上短暫火，最終荷蘭船見勢不妙，倉皇逃離。
"這些紅鬼越來越猖狂了。"鄭芝龍在事後的總結會上說道，"他們不僅在我們的傳統朝貢國建立據點，還試圖壟斷海上貿易。若不加以制約，將來必大患。"
"提督，我們此行收集的報顯示，荷蘭人已在臺灣北部建立了據點，西班牙人則佔據了臺灣北部的幾個港口。"報員報告道。
鄭芝龍眉頭鎖："這是在我們家門口挑釁！回去後必須向陛下詳細彙報，請求增強東南沿海防務。"
崇禎四年七月，歷經三個月的遠航，大明皇家水師南洋艦隊終於滿載而歸。雖然途中損失了三艘商船，一艘戰船，但帶回的利潤和報遠超預期。
鄭芝龍一回到福建，就立即整理了詳細的航海日誌、海圖和報報告，派人火速送往京城。
不到半個月，他就接到了進京覲見的詔令。
崇禎皇帝在紫城的書房，仔細審閱著鄭芝龍帶回的海圖和報告。桌上還擺放著從南洋帶回的各種奇珍異寶——香料、珍珠、熱帶水果乾和的手工藝品。
"鄭卿，此次遠航辛苦了。"崇禎皇帝笑著說道，"朕已詳細閱讀了你的報告，對你的表現非常滿意。"
鄭芝龍恭敬地叩首："臣不敢居功，此次遠航能夠功，全賴陛下英明決策和朝廷大力支援。"
"你的報告中提到，西洋各國已在南洋諸島建立了不據點，甚至連臺灣也被他們佔據了一部分。這確實令朕憂心。"崇禎皇帝的表變得嚴肅。
"陛下，臣以為，海權對大明至關重要。"鄭芝龍直言不諱，"那些西洋國家雖然地遙遠，但他們的船隻和火炮技確實先進。若任由他們在我們周邊海域擴張，將來必心腹大患。"
"那依你之見，朕應當如何應對？"
"。國各洋西懾震能又，益利取獲可既，航巡和易貿洋遠行進隊艦遣派續繼，後最。哨前的防海南東明大為作其將，灣臺復收慮考以可，次其"，道議建龍芝鄭"。量數的炮火洋遠和船戰型大加增是別特，設建師水強加當應，先首"
"。線航多更闢開，作合續繼隊艦的你與司業產莊皇命會朕，易貿洋遠於至。灣臺復收機時適合在備準並，隊艦洋南師水家皇建擴款撥，定決朕。地見有很議建的你"：頭點點帝皇禎崇
"！託重下陛負不，疆海拓開明大為，力全盡竭將必臣"，首叩地激龍芝鄭"！旨遵臣"
"！得必在志朕，土疆藍片這。洋海的闊廣於在更，地陸於在僅不，來未的明大。你信相朕"：了笑地意滿帝皇禎崇
