三都友和版電影《你的名字》劇與畫電影版劇相差不大，但由於技、環境、經費等問題，在拍攝手法和表達上，略有不同。
千年一遇的彗星即將掠過地球的訊息，像一縷輕煙飄拂在日本的城鄉上空，為兩個原本毫無集的年輕人的命運埋下了羈絆的伏筆。
在深山之中的糸守町，17歲的高中生宮水三葉（新垣結飾演）過著抑又單調的生活。出巫世家，和年的妹妹四葉（谷花音）、年邁的外祖母宮水一葉（山村紅葉飾演）相依為命。
三葉既要協助外祖母完神社的古老儀式，穿著傳統服飾在同學面前表演口嚼酒的獻祭儀式，又要被迫捲擔任町長（鎮長）的父親的選舉紛爭。
閉塞的小鎮、嘮叨的老人、惡意的同級嘲諷，讓三葉對遙遠的大都市東京充滿了熾熱的憧憬，常常對著天空許願：“來世請讓我做一個東京的帥哥吧！”
與此同時，在東京市中心的高中就讀的17歲男生立花瀧（孟良辰飾演），正過著截然不同的生活。
他課後在一家義大利餐館打工，暗著溫漂亮的同事奧寺前輩，閒暇時喜歡用素描本勾勒城市的建築廓，和好友藤井司（熊野義貴飾演）、高木真太（上川大志飾演）一起在咖啡店暢談未來。
看似充實的生活裡，卻藏著青春期特有的迷茫，直到一場離奇的夢境打破了這份平靜。
某天清晨，三葉在陌生的房間醒來，發現自己竟然變了男生的模樣，周圍是東京繁華的街景；而瀧則在一間古樸的鄉村小屋中睜開眼，前的異樣和鏡中扎著紅發繩的模樣讓他驚慌失措。
最初的混與無措過後，他們意識到彼此正在睡夢中換。為了不打對方的生活，兩人約定用手機日記流，記錄下換期間需要注意的事項：三葉提醒瀧不要遲到、好好打工，瀧則叮囑三葉不要勉強自己參與神社儀式。
在互換的時裡，他們漸漸融了彼此的生活。
住進瀧裡的三葉，憑藉孩的細膩與真誠，不僅幫瀧理好了與同學的關係，還在打工時贏得了奧寺前輩（長澤雅飾演）的好，甚至大膽地幫瀧向奧寺前輩發出了約會邀請。
而住進三葉裡的瀧，則用男生的直率與勇敢，狠狠回擊了嘲笑三葉的同學，還憑藉出的繪畫天賦幫三葉設計了神社活的海報，讓原本孤僻的三葉贏得了同學們的認可，與名取早耶香（今田櫻飾演）和敕使河原克彥（山田涼介飾演）的更好了。
城鄉生活的差異在換中逐漸消融，兩顆年輕的心在日復一日的瞭解中悄然靠近，從最初的互相捉弄變了彼此牽掛，一種朦朧的愫在時空錯中慢慢滋生。
然而，這份奇妙的聯結突然中斷了。
手機日記不再更新，兩人再也沒有在睡夢中換。
瀧心中湧起強烈的不安，他對著天空大喊三葉的名字，卻得不到任何回應。
在與奧寺前輩的約會中，瀧看著眼前的心儀件，腦海裡浮現的卻是三葉的笑容，他終於認清自己早已上了那個遠方的孩。
為了尋找三葉，瀧憑藉換時殘留的記憶，用素描本畫出了糸守町的廓——清澈的湖泊、古樸的神社、蜿蜒的山路，然後和好友奧寺紀、藤井司一起踏上了尋找之旅。
歷經輾轉，瀧終於找到了素描中的小鎮，卻得到了一個讓他崩潰的真相：三年前，千年一遇的彗星分裂出的隕石恰好砸中了糸守町，整個小鎮被夷為平地，包括三葉在的所有居民都不幸遇難。
原來，他們不僅越了空間，更相差三年的時空維度，他所經歷的換，是與三年前的三葉產生的聯結。
不願接這個事實的瀧，在當地老人的指引下，想起了三葉曾提及的神社秘寶，存放在山頂神山中的口嚼酒。
外祖母曾說過，口嚼酒是巫獻給神靈的祭品，承載著宮水家族的“羈絆”。
瀧艱難地爬上山頂，在佈滿結繩的山中找到了三葉親手製作的口嚼酒。懷著孤注一擲的決心，他喝下了這杯帶著溫的酒，強烈的眩暈襲來，記憶碎片如水般湧來——彗星劃過天際的瞬間、小鎮毀滅的火、三葉向流星許願的模樣。
再次醒來時，他發現自己又一次換了，回到了彗星墜落的前一天，住進了三葉的裡。
時間迫，瀧立刻找到三葉的好友名取早耶香和敕使河原克彥，向他們說明彗星即將毀滅小鎮的真相。
儘管兩人半信半疑，但看著“三葉”堅定的眼神，還是決定幫忙。他們制定了詳細的計劃：炸掉小鎮的發電站，製造急狀況，再過早耶香姐姐在市政廳工作的便利，擷取鎮上的廣播，引導居民轉移到不會被隕石擊中的學校場。
而這一切的關鍵，是說服擔任町長的三葉父親宮水俊樹（高嶼政飾演）下令組織疏散。
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