在歷經艱辛收復臺灣後，張好古深知要鞏固這一來之不易的果，必須建立一套完備且高效的行政系。他迅速行，以卓越的政治智慧和長遠的戰略眼，開啟了臺灣治理的新篇章。
張好古首先對臺灣的行政區劃進行了科學合理的規劃。他將臺灣島暫設為一府，下設臺北縣、臺南縣、臺中縣這三縣，府治定於臺中。
這一佈局充分考慮了臺灣的地理特點和發展需求，臺中位於臺灣中部，作為府治能夠更好地輻全島，協調各縣事務。而臺北、臺南、臺中三縣的設立，則讓不同區域的行政管理更加準到位。
府縣之下，他在宋應升的協助下又層層構建起各級行政機構，從府衙到縣衙，再到鄉鎮里甲，每一級機構都職責分明，確保政令能夠從上至下暢通無阻，各項政策能夠及時有效地傳達和執行。
在人才選拔與任用方面，張好古毫不馬虎。他深知人才是治理的關鍵，於是廣納賢才，從大陸心挑選了一批德才兼備的員。
這些員不僅備富的行政管理經驗，還帶來了大陸先進的發展理念和治理模式。他們到任後，迅速投到臺灣的各項建設與管理中，將大陸的制度、方法因地制宜地運用到臺灣，為臺灣的治理注了新的活力。
同時，張好古也注重從當地選拔人才，讓悉本地況的人參與到治理中來，實現大陸經驗與本地實際的有機結合。
對於當地的土著居民，張好古更是給予了高度重視。他明白，要實現臺灣的長治久安，必須妥善理好與土著的關係。
張好古制定了一系列合理的安政策，尊重土著的風俗習慣和傳統信仰，保障他們的合法權益。
在土地分配、資源利用等方面，充分考慮土著的利益，避免因政策不當引發衝突。他還積極促進大陸移民與土著之間的流與融合，過經濟往來、文化互等方式，增進彼此的瞭解與信任。
這些舉措有效地緩解了大陸與土著之間的矛盾，讓不同族群能夠和睦相，共同為臺灣的發展貢獻力量。
在張好古的心治理下，臺灣的行政系日益完善，社會秩序逐漸穩定，經濟也開始蓬發展。他的這一系列舉措，不僅為臺灣的後續發展奠定了堅實的基礎，更彰顯了他卓越的治理才能和深遠的政治眼，讓臺灣在收復後迅速走上了繁榮穩定的道路。
臺灣島土地沃，氣候適宜，擁有發展農業的天然優勢，然而在被荷蘭民統治期間，農業生產技落後，經濟發展到嚴重製約。
張好古收復臺灣後，深刻認識到農業是經濟發展的基，於是大力推行屯田政策，並積極發展手工業和商業，為臺灣的經濟繁榮開闢了新的道路。
張好古到達臺灣後，面對農業生產的落後局面，迅速組織軍隊和民眾開墾荒地。他將大量軍隊轉化為生產力量，實行“寓兵於農”的政策，士兵們在執行軍事任務的同時，參與農業生產。在廣大民眾的共同努力下，大量荒蕪的土地被開墾出來，變良田。
興修水利是改善農業生產條件的關鍵舉措。張好古組織人力修建水渠、堤壩等水利設施，有效解決了農田灌溉問題。水利工程的興建，使得臺灣的農業生產不再完全依賴自然降雨，大大提高了農業的抗旱能力，為農作的穩產高產提供了保障。
屯田政策的實施效顯著。軍隊和民眾過辛勤勞作，種植水稻、甘蔗、番薯等農作，糧食產量大幅提高。
這不僅解決了軍隊的糧食供應問題，使軍隊能夠自給自足，減輕了百姓的負擔，還為臺灣的經濟發展提供了堅實的質基礎。充足的糧食供應，使得臺灣社會逐漸穩定，為其他產業的發展創造了有利條件。
張好古深知單一的經濟結構難以支撐臺灣的長期發展，於是在發展農業的同時，積極鼓勵大陸的工匠和商人到臺灣發展。許多通紡織、製糖、陶瓷等技的工匠紛紛來到臺灣，帶來了先進的生產技和富的生產經驗。
另外對松江府的工廠主，張好古也發出邀請，可以來臺灣府發展，提出三年免稅的好。
在紡織業方面，大陸工匠傳授了先進的紡織技，臺灣的紡織業逐漸興起。
當地民眾學會了紡紗、織布等技能，生產出質量更好的紡織品，不僅滿足了本地需求，還開始對外銷售。
製糖業也發展迅速，臺灣盛產的甘蔗經過大陸工匠的改良加工，製出的蔗糖質量上乘，為重要的出口商品。此外，陶瓷、造船等行業也得到了一定程度的發展，臺灣的手工業呈現出多元化的趨勢。
手工業的發展，不僅增加了臺灣的經濟收，還提供了大量的就業機會，吸引了更多的人口來到臺灣，進一步促進了臺灣的繁榮。
張好古積極推臺灣與大陸、東南亞等地的商業貿易往來。臺灣富的產，如蔗糖、鹿皮、稻米等，過海上貿易大量出口到大陸和東南亞地區。這些產在市場上備青睞，為臺灣帶來了可觀的經濟收益。
同時，臺灣也從大陸和東南亞進口了各種生活必需品和生產資料。大陸的綢、瓷、茶葉等商品富了臺灣民眾的生活，而東南亞的香料、木材等則為臺灣的手工業發展提供了原材料。這種雙向的貿易往來，使得臺灣的經濟與外部世界相連。
為了促進商業的發展，張好古還採取了一系列措施。他整頓市場秩序，打擊商業欺詐行為，保障商人的合法權益。同時，他鼓勵商人組建商會，加強行業自律，提高商業運作的效率。
此外，他還改善港口設施，為海上貿易提供便利，吸引了更多的商船來到臺灣進行貿易活。
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