小智他們穿著火箭隊的潛水服，游到基地下方。然後用波導像一張大網一樣，把整個基地都籠罩起來。
瑪夏多則“嗖”的一聲，化影溜進了基地裡。有了上帝視角的加持，再加上瑪夏多那神出鬼沒的影潛能力。
小智和他的夥伴迅速突破了火箭隊的基地，毫不費力擊敗小三郎和亞麻多，然後順利進了最後的房間。
當他們推開門時，一強烈的能量波撲面而來。小智定睛一看，只見房間中央的實驗臺上，一隻巨大的奇亞正被束縛在那裡，外面則是被一個紅防護罩隔絕著。
“歡迎各位到來！我是這個基地和這次計劃的負責人，南波博士。”
一個聲音從上方傳來，小智抬頭看去，只見南波博士站在實驗室的高臺上，得意洋洋著他們。
“不過，我的計劃已經完了，接下來你們將見證神蹟的誕生！”南波博士狂笑著，他的眼中出瘋狂和自信。
小霞突然指著奇亞說道“看，那不是我們在橘子群島見過的奇亞嗎？”
小智觀察了一下，搖了搖頭說“不，雖然外表長的一模一樣，但這並不是我們在橘子群島上遇到的那隻。”
瑪夏多走上前來，向大家解釋道“這隻奇亞應該是它的族人。”
“你這傢伙到底想幹什麼？”小智死死的盯著眼前的南波。
南波的手握住護欄，由於太過用力，手指關節有些發白。
他的抖著，顯然被小智的質問激怒了，強忍著怒火“我不是什麼傢伙，我南波，給我記住，我南波！”
小智本不在意南波的強調，他的注意力完全被奇亞和海面上那些神奇寶貝吸引住了。只見奇亞和其他神奇寶貝們都顯得十分痛苦，發出陣陣哀鳴。
“我管你是金波還是銀波，馬上把奇亞還有海面上那些神奇寶貝給我放了！”
小智的聲音馬上提高，帶著明顯的怒意“不然，你絕對不會有什麼好果子吃的！”
南波終於忍不住了，像被點燃的炸藥桶一樣，瞬間發
“我再說一遍啊，我南波！你們這群小鬼，本不懂我所做的一切！”
“我想以神奇寶貝之力為基，開發新能源，繼而推人類發展。至於如何調力量，你們過畫面都看到了，激怒它們就是最好的辦法。”
言罷，便為自的計劃洋洋得意。
小剛駁斥道“這樣本行不通，神奇寶貝與人一樣，如此刻意製造憤怒，神奇寶貝的大腦、消化、免疫等系統皆會遭破壞，這樣它們的健康和壽命都長不了的。”
“這有什麼關係，死了再抓下一隻就是，這個世界神奇寶貝多的是，本來它們就生來是為人類服務的。”
小霞面一沉“你這算哪門子博士，簡直一派胡言！”
一旁的小智亦是面沉，從未這麼憤怒過“你怎不去死啊！”他們這些訓練家，都將神奇寶貝視為至親之人，是絕不可能接這種東西。
南波對他們的話置若罔聞，按下按鈕“奇亞，發怒吧，讓我好看看你能發揮出什麼樣的力量。”
紅保護罩有了開始要開啟的鬆。
小智見狀不妙，在此地發大戰，勢必會波及小霞與小剛。
“瑪夏多。”瑪夏多一拳將地板擊穿，海水源源不絕倒灌而。
