不一會兒便有數千人攻進泉州城，與守城的清軍進行搏戰。
這時候在後面督戰的劉驍源也拔出指揮刀，命令全軍發進攻，頃刻間近萬名漢軍兵再次發流般的衝鋒。
眼見府城己經守不住了，知府馬壽祺當即趁帶著十幾個親隨騎馬趕回私宅。
此時，遠遠聽到喊殺聲，何歡知道城牆己然被攻破，不然喊殺聲不會傳那麼遠，於是早就命令家僕和護院趕快收拾東西，等知府大人回來之後，馬上撤離。
馬壽祺的撤離路線，早就規劃好了，此時他縱馬狂奔，也不管會不會撞到行人，即使撞到了，他也不做片刻停留，首接換馬再跑。
不一會兒，馬壽祺便逃回了自己私宅門口，見自己夫人己經帶著家僕和護院揹著大包小包，在等候自己，當即喊道：“叛軍己經攻進來了，府城不保，迅速跟隨我撤離！”
隨後，他抱起何歡，幾乎馬不停蹄地往東南門跑去，而他的百餘名親衛、護院也大多騎馬跟上。
他們奔跑了不一會兒出了東南門，此時城裡面的人，大多沒有人往這邊跑，只有一些縉紳在這裡也留了後手，才也往這裡跑，所以碼頭附近沒有什麼人，馬壽祺等人很快便逃上了水師給他們準備的船隻。
馬壽祺和何歡上船之後，顧不上息，何歡便下令開船逃往金門島。
只見他們的船和幾艘水師艦艇駛出不到五里，便見懸掛漢字旗的漢軍艦艇，便駛進了泉州府東南門外碼頭，封鎖住縉紳從水路逃跑的路線。
見這一幕，馬壽祺嚇得抱自己的妻道：“幸好夫人早有謀劃，不然恐怕明日我的頭顱就會被高懸泉州府城城頭！”
由於他們乘坐的是小型快船，此時風帆早己經拉滿，加上順流，漢軍戰艦己經無法追上，所以漢軍水師將領只能放棄了進一步追擊。
這艘快船航行了三個多小時之後，終於到達了金門島，馬壽祺等人功逃到了金門島上。
當晚，金門鎮總兵孫鼎鰲聯袂駐在金門島的眾多員，還專門設宴宴請了馬壽祺一行人。
原因無他，倆人一個是清廷駐泉州府文最高長，另一個是清軍駐紮泉州府最高武，平時私下關係非常好。
至於綠營軍參將胡仁有沒有逃出來，宴會上沒有人問，也沒有人提，因為胡仁本在營中就是一個異類，才被派去領著刺頭部隊去守城，這就是大清場。
在金門島上的清廷文武員胡吃海喝的時候，攻下泉州府城的漢軍終於藉助宵，穩住了泉州府城的局勢，完全控制住了泉州府城。
在今天中午時分，從仙遊出發的清軍援軍在進晉江河不久，便被漢軍艦艇發現，漢軍將領水師將領黃添丁噹即下令五艘戰艦迎上去炮擊對方。
由於清軍以為泉州府碼頭還未丟失，所以派出的艦船主要是運輸船，承載著援軍，又是逆流而上，一下子便被追上來的漢軍戰艦圍著用火炮猛轟。
在後面的二十幾艘利用漢軍艦船較，趁機調轉船頭原路逃了出去，因為擔心漢軍艦艇會繼續追擊，出海之後，便將船開往金門島，使得金門島清軍守軍又增加了三千多人。
而清軍援軍的前鋒十幾艘船要麼被俘，要麼被擊沉，上千人被漢軍俘虜，其中有不是原來紅錢會義軍，便被漢軍擇優編了漢軍。
由於府城裡面的縉紳覺得援軍會到來，泉州府城守住沒有問題，所以包括洪世昭、陳慶鏞、莊俊元、柯琮璜等人均沒有做好城破逃跑的準備。
府城城破之時，等他們反應過來的時候，泉州知府馬壽祺早己經不知所蹤，眾人想逃出城，才發現各城門先後被漢軍佔領，只能率領自家團練和護院進行殊死反抗。
消滅了清軍援軍之後，漢軍集中了力量，對仍然反抗的團練和綠營兵進行清剿，在優勢兵力下，漢軍在下午西時便陸陸續續地清剿乾淨城中反抗力量，抓捕了以洪世昭為首反抗漢軍進攻的縉紳，並抄沒了眾多鄉紳的家產。
而清軍綠營軍參將則是在城破不久之後，在戰鬥中被漢軍步槍擊中當場殞命的，殘存不到兩百的綠營兵紛紛向漢軍投降。
潛伏在泉州府城的人民黨員，陸續向城漢軍檢舉以承天寺為首的寺廟捐巨資和派僧兵助清軍守城的況，劉驍源早就對這些人不滿，當即命令部隊抄沒這些反寺廟的資產，並將各寺主持擒拿歸案。
當夜，漢軍還利用宵，組織部隊分片區對府城城區進行拉網式的搜捕，清理殘餘的縉紳勢力和反抗力量。
當然，為了避免士兵藉機欺負百姓，漢軍在平時進行政治教育的同時，在開展搜捕之前，再次嚴明紀律，並派出執法隊，晚上當場決了兩名試圖民的漢軍士兵。
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